¿El cariotipo permite evaluar si están presentes todas sus regiones?

No, mediante el cariotipo sólo se analiza el número y estructura de los cromosomas pero no su contenido. Es decir, no se analizan todos los genes que lo contienen. De modo que mediante el cariotipo podemos descartar todas las alteraciones genéticas de base cromosómica pero no las que afectan a pequeñas regiones.